La compagnie nationale des Seychelles permet de desservir l'aéroport d'Antananarivo grâce à l'Alliance Vanille qu'elle signe en 2015 avec les lignes aériennes Air France, British Airways ou encore Air Madagascar pour assurer des liaisons entres toutes les îles Vanille de l'océan Indien, y compris l'île Maurice et la Réunion. Mais ne possédant plus d'avion long courrier, c'est principalement depuis la république des Seychelles que la compagnie atterrit à Madagascar.